Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ercc6l2Q9JIM3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ercc6l2Q9JIM3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ercc6l2Q9JIM3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ercc6l2Q9JIM3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ercc6l2Q9JIM3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ercc6l2Q9JIM3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ercc6l2Q9JIM3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ercc6l2Q9JIM3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ercc6l2Q9JIM3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ercc6l2Q9JIM3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ercc6l2Q9JIM3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ercc6l2Q9JIM3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ercc6l2Q9JIM3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ercc6l2Q9JIM3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ercc6l2Q9JIM3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ercc6l2Q9JIM3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ercc6l2Q9JIM3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC27■■□□□ 1.91
Ercc6l2Q9JIM3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Ercc6l2Q9JIM3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ercc6l2Q9JIM3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ercc6l2Q9JIM3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ercc6l2Q9JIM3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ercc6l2Q9JIM3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Ercc6l2Q9JIM3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ercc6l2Q9JIM3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ercc6l2Q9JIM3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ercc6l2Q9JIM3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ercc6l2Q9JIM3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ercc6l2Q9JIM3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ercc6l2Q9JIM3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Ercc6l2Q9JIM3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ercc6l2Q9JIM3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ercc6l2Q9JIM3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ercc6l2Q9JIM3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ercc6l2Q9JIM3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Ercc6l2Q9JIM3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ercc6l2Q9JIM3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ercc6l2Q9JIM3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ercc6l2Q9JIM3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ercc6l2Q9JIM3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ercc6l2Q9JIM3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ercc6l2Q9JIM3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ercc6l2Q9JIM3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ercc6l2Q9JIM3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ercc6l2Q9JIM3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ercc6l2Q9JIM3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ercc6l2Q9JIM3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ercc6l2Q9JIM3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ercc6l2Q9JIM3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ercc6l2Q9JIM3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ercc6l2Q9JIM3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Ercc6l2Q9JIM3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ercc6l2Q9JIM3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ercc6l2Q9JIM3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Ercc6l2Q9JIM3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ercc6l2Q9JIM3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ercc6l2Q9JIM3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ercc6l2Q9JIM3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ercc6l2Q9JIM3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ercc6l2Q9JIM3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ercc6l2Q9JIM3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ercc6l2Q9JIM3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ercc6l2Q9JIM3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ercc6l2Q9JIM3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ercc6l2Q9JIM3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ercc6l2Q9JIM3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Ercc6l2Q9JIM3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ercc6l2Q9JIM3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ercc6l2Q9JIM3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ercc6l2Q9JIM3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ercc6l2Q9JIM3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ercc6l2Q9JIM3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ercc6l2Q9JIM3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ercc6l2Q9JIM3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ercc6l2Q9JIM3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ercc6l2Q9JIM3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ercc6l2Q9JIM3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ercc6l2Q9JIM3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ercc6l2Q9JIM3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ercc6l2Q9JIM3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ercc6l2Q9JIM3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ercc6l2Q9JIM3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ercc6l2Q9JIM3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ercc6l2Q9JIM3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ercc6l2Q9JIM3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ercc6l2Q9JIM3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ercc6l2Q9JIM3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ercc6l2Q9JIM3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ercc6l2Q9JIM3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ercc6l2Q9JIM3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ercc6l2Q9JIM3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ercc6l2Q9JIM3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ercc6l2Q9JIM3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ercc6l2Q9JIM3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ercc6l2Q9JIM3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms