Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tcirg1Q9JHF5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Tcirg1Q9JHF5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tcirg1Q9JHF5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tcirg1Q9JHF5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tcirg1Q9JHF5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tcirg1Q9JHF5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tcirg1Q9JHF5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tcirg1Q9JHF5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tcirg1Q9JHF5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tcirg1Q9JHF5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tcirg1Q9JHF5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tcirg1Q9JHF5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tcirg1Q9JHF5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Tcirg1Q9JHF5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tcirg1Q9JHF5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tcirg1Q9JHF5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tcirg1Q9JHF5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tcirg1Q9JHF5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tcirg1Q9JHF5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tcirg1Q9JHF5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tcirg1Q9JHF5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tcirg1Q9JHF5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Tcirg1Q9JHF5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tcirg1Q9JHF5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tcirg1Q9JHF5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms