Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX4

Zcchc17, Nucleolar protein of 40 kDa, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc17Q9ESX4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zcchc17Q9ESX4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms