Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK3

Capn10, Calpain-10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn10Q9ESK3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn10Q9ESK3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn10Q9ESK3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn10Q9ESK3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn10Q9ESK3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn10Q9ESK3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn10Q9ESK3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn10Q9ESK3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn10Q9ESK3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn10Q9ESK3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn10Q9ESK3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn10Q9ESK3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn10Q9ESK3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn10Q9ESK3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn10Q9ESK3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn10Q9ESK3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn10Q9ESK3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn10Q9ESK3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn10Q9ESK3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn10Q9ESK3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn10Q9ESK3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn10Q9ESK3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn10Q9ESK3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn10Q9ESK3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn10Q9ESK3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn10Q9ESK3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn10Q9ESK3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn10Q9ESK3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn10Q9ESK3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn10Q9ESK3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn10Q9ESK3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn10Q9ESK3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn10Q9ESK3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn10Q9ESK3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn10Q9ESK3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn10Q9ESK3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn10Q9ESK3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn10Q9ESK3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Capn10Q9ESK3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms