Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES82

Popdc2, Popeye domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Popdc2Q9ES82 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Popdc2Q9ES82 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Popdc2Q9ES82 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Popdc2Q9ES82 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Popdc2Q9ES82 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Popdc2Q9ES82 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Popdc2Q9ES82 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Popdc2Q9ES82 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Popdc2Q9ES82 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Popdc2Q9ES82 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Popdc2Q9ES82 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Popdc2Q9ES82 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Popdc2Q9ES82 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Popdc2Q9ES82 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Popdc2Q9ES82 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Popdc2Q9ES82 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Popdc2Q9ES82 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Popdc2Q9ES82 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Popdc2Q9ES82 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Popdc2Q9ES82 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Popdc2Q9ES82 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Popdc2Q9ES82 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Popdc2Q9ES82 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Popdc2Q9ES82 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Popdc2Q9ES82 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Popdc2Q9ES82 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Popdc2Q9ES82 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Popdc2Q9ES82 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms