Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp29Q9ES63 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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Usp29Q9ES63 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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Usp29Q9ES63 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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Usp29Q9ES63 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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Usp29Q9ES63 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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