Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms