Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK0

Ripk4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk4Q9ERK0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms