Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc28a3Q9ERH8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms