Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tfcp2Q9ERA0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms