Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Scn4aQ9ER60 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Scn4aQ9ER60 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Scn4aQ9ER60 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Scn4aQ9ER60 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Scn4aQ9ER60 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Scn4aQ9ER60 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Scn4aQ9ER60 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Scn4aQ9ER60 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Scn4aQ9ER60 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Scn4aQ9ER60 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Scn4aQ9ER60 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Scn4aQ9ER60 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scn4aQ9ER60 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scn4aQ9ER60 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scn4aQ9ER60 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Scn4aQ9ER60 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Scn4aQ9ER60 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scn4aQ9ER60 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scn4aQ9ER60 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scn4aQ9ER60 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scn4aQ9ER60 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scn4aQ9ER60 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Scn4aQ9ER60 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Scn4aQ9ER60 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Scn4aQ9ER60 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Scn4aQ9ER60 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Scn4aQ9ER60 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Scn4aQ9ER60 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Scn4aQ9ER60 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Scn4aQ9ER60 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Scn4aQ9ER60 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Scn4aQ9ER60 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Scn4aQ9ER60 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Scn4aQ9ER60 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Scn4aQ9ER60 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Scn4aQ9ER60 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Scn4aQ9ER60 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Scn4aQ9ER60 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Scn4aQ9ER60 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Scn4aQ9ER60 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Scn4aQ9ER60 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Scn4aQ9ER60 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Scn4aQ9ER60 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Scn4aQ9ER60 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Scn4aQ9ER60 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Scn4aQ9ER60 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scn4aQ9ER60 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scn4aQ9ER60 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scn4aQ9ER60 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scn4aQ9ER60 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scn4aQ9ER60 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scn4aQ9ER60 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Scn4aQ9ER60 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scn4aQ9ER60 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scn4aQ9ER60 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scn4aQ9ER60 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scn4aQ9ER60 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scn4aQ9ER60 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Scn4aQ9ER60 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Scn4aQ9ER60 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scn4aQ9ER60 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scn4aQ9ER60 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scn4aQ9ER60 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scn4aQ9ER60 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scn4aQ9ER60 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scn4aQ9ER60 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Scn4aQ9ER60 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Scn4aQ9ER60 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Scn4aQ9ER60 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Scn4aQ9ER60 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Scn4aQ9ER60 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Scn4aQ9ER60 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
Scn4aQ9ER60 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Scn4aQ9ER60 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Scn4aQ9ER60 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Scn4aQ9ER60 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Scn4aQ9ER60 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Scn4aQ9ER60 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Scn4aQ9ER60 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Scn4aQ9ER60 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Scn4aQ9ER60 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Scn4aQ9ER60 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Scn4aQ9ER60 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Scn4aQ9ER60 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Scn4aQ9ER60 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Scn4aQ9ER60 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Scn4aQ9ER60 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Scn4aQ9ER60 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Scn4aQ9ER60 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Scn4aQ9ER60 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Scn4aQ9ER60 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Scn4aQ9ER60 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Scn4aQ9ER60 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Scn4aQ9ER60 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Scn4aQ9ER60 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Scn4aQ9ER60 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Scn4aQ9ER60 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Scn4aQ9ER60 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Scn4aQ9ER60 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms