Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQG9

Col4a3bp, Collagen type IV alpha-3-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3bpQ9EQG9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col4a3bpQ9EQG9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col4a3bpQ9EQG9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col4a3bpQ9EQG9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col4a3bpQ9EQG9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col4a3bpQ9EQG9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col4a3bpQ9EQG9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col4a3bpQ9EQG9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col4a3bpQ9EQG9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Col4a3bpQ9EQG9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Col4a3bpQ9EQG9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Col4a3bpQ9EQG9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col4a3bpQ9EQG9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col4a3bpQ9EQG9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col4a3bpQ9EQG9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col4a3bpQ9EQG9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col4a3bpQ9EQG9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col4a3bpQ9EQG9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col4a3bpQ9EQG9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col4a3bpQ9EQG9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col4a3bpQ9EQG9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col4a3bpQ9EQG9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col4a3bpQ9EQG9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col4a3bpQ9EQG9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col4a3bpQ9EQG9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col4a3bpQ9EQG9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col4a3bpQ9EQG9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Col4a3bpQ9EQG9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col4a3bpQ9EQG9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col4a3bpQ9EQG9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col4a3bpQ9EQG9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col4a3bpQ9EQG9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Col4a3bpQ9EQG9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Col4a3bpQ9EQG9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms