Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms