Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clstn1Q9EPL2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms