Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCP2

Slc38a3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a3Q9DCP2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc38a3Q9DCP2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc38a3Q9DCP2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc38a3Q9DCP2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc38a3Q9DCP2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc38a3Q9DCP2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc38a3Q9DCP2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc38a3Q9DCP2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc38a3Q9DCP2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc38a3Q9DCP2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc38a3Q9DCP2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc38a3Q9DCP2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc38a3Q9DCP2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc38a3Q9DCP2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc38a3Q9DCP2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc38a3Q9DCP2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc38a3Q9DCP2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc38a3Q9DCP2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc38a3Q9DCP2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc38a3Q9DCP2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc38a3Q9DCP2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc38a3Q9DCP2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc38a3Q9DCP2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc38a3Q9DCP2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc38a3Q9DCP2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc38a3Q9DCP2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc38a3Q9DCP2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc38a3Q9DCP2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc38a3Q9DCP2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc38a3Q9DCP2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc38a3Q9DCP2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc38a3Q9DCP2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms