Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ndufa8Q9DCJ5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms