Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms