Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trmt112Q9DCG9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms