Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Csnk1dQ9DC28 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
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Csnk1dQ9DC28 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Csnk1dQ9DC28 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Csnk1dQ9DC28 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Csnk1dQ9DC28 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Csnk1dQ9DC28 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Csnk1dQ9DC28 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Csnk1dQ9DC28 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Csnk1dQ9DC28 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Csnk1dQ9DC28 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Csnk1dQ9DC28 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Csnk1dQ9DC28 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Csnk1dQ9DC28 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Csnk1dQ9DC28 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Csnk1dQ9DC28 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Csnk1dQ9DC28 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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