Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ftsj3Q9DBE9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms