Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAU1

Cnpy3, Protein canopy homolog 3, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy3Q9DAU1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnpy3Q9DAU1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnpy3Q9DAU1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnpy3Q9DAU1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnpy3Q9DAU1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnpy3Q9DAU1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnpy3Q9DAU1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnpy3Q9DAU1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnpy3Q9DAU1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnpy3Q9DAU1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnpy3Q9DAU1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnpy3Q9DAU1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnpy3Q9DAU1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnpy3Q9DAU1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnpy3Q9DAU1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnpy3Q9DAU1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnpy3Q9DAU1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnpy3Q9DAU1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnpy3Q9DAU1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnpy3Q9DAU1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnpy3Q9DAU1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnpy3Q9DAU1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnpy3Q9DAU1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnpy3Q9DAU1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnpy3Q9DAU1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnpy3Q9DAU1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnpy3Q9DAU1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnpy3Q9DAU1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnpy3Q9DAU1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnpy3Q9DAU1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnpy3Q9DAU1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnpy3Q9DAU1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnpy3Q9DAU1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnpy3Q9DAU1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnpy3Q9DAU1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnpy3Q9DAU1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnpy3Q9DAU1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnpy3Q9DAU1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cnpy3Q9DAU1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cnpy3Q9DAU1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cnpy3Q9DAU1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cnpy3Q9DAU1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cnpy3Q9DAU1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnpy3Q9DAU1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms