Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Actrt1Q9D9J3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Actrt1Q9D9J3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Actrt1Q9D9J3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Actrt1Q9D9J3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Actrt1Q9D9J3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Actrt1Q9D9J3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Actrt1Q9D9J3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actrt1Q9D9J3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms