Protein–RNA interactions for Protein: Q9D995

Cntd1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntd1Q9D995 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntd1Q9D995 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntd1Q9D995 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntd1Q9D995 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntd1Q9D995 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntd1Q9D995 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntd1Q9D995 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntd1Q9D995 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntd1Q9D995 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntd1Q9D995 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntd1Q9D995 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntd1Q9D995 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntd1Q9D995 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntd1Q9D995 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntd1Q9D995 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntd1Q9D995 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntd1Q9D995 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntd1Q9D995 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntd1Q9D995 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntd1Q9D995 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntd1Q9D995 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntd1Q9D995 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntd1Q9D995 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntd1Q9D995 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntd1Q9D995 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntd1Q9D995 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntd1Q9D995 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntd1Q9D995 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntd1Q9D995 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntd1Q9D995 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntd1Q9D995 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntd1Q9D995 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntd1Q9D995 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntd1Q9D995 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntd1Q9D995 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntd1Q9D995 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntd1Q9D995 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntd1Q9D995 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntd1Q9D995 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntd1Q9D995 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntd1Q9D995 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntd1Q9D995 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntd1Q9D995 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntd1Q9D995 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms