Protein–RNA interactions for Protein: Q9D915

Tcim, Transcriptional and immune response regulator, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TcimQ9D915 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TcimQ9D915 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TcimQ9D915 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TcimQ9D915 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TcimQ9D915 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TcimQ9D915 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TcimQ9D915 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TcimQ9D915 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TcimQ9D915 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TcimQ9D915 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TcimQ9D915 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TcimQ9D915 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TcimQ9D915 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TcimQ9D915 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TcimQ9D915 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TcimQ9D915 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TcimQ9D915 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TcimQ9D915 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TcimQ9D915 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TcimQ9D915 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TcimQ9D915 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TcimQ9D915 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TcimQ9D915 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TcimQ9D915 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TcimQ9D915 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TcimQ9D915 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms