Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms