Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms