Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Alkbh4Q9D8F1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Alkbh4Q9D8F1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Alkbh4Q9D8F1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Alkbh4Q9D8F1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Alkbh4Q9D8F1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Alkbh4Q9D8F1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Alkbh4Q9D8F1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Alkbh4Q9D8F1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Alkbh4Q9D8F1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Alkbh4Q9D8F1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Alkbh4Q9D8F1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Alkbh4Q9D8F1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Alkbh4Q9D8F1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Alkbh4Q9D8F1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Alkbh4Q9D8F1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Alkbh4Q9D8F1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Alkbh4Q9D8F1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Alkbh4Q9D8F1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Alkbh4Q9D8F1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Alkbh4Q9D8F1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Alkbh4Q9D8F1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Alkbh4Q9D8F1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Alkbh4Q9D8F1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms