Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms