Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms