Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7V1

Sh2d4a, SH2 domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d4aQ9D7V1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh2d4aQ9D7V1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms