Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chmp5Q9D7S9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chmp5Q9D7S9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms