Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Capns2Q9D7J7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Capns2Q9D7J7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Capns2Q9D7J7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Capns2Q9D7J7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capns2Q9D7J7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capns2Q9D7J7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capns2Q9D7J7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capns2Q9D7J7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capns2Q9D7J7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capns2Q9D7J7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capns2Q9D7J7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capns2Q9D7J7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capns2Q9D7J7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Capns2Q9D7J7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capns2Q9D7J7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Capns2Q9D7J7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capns2Q9D7J7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capns2Q9D7J7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Capns2Q9D7J7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capns2Q9D7J7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capns2Q9D7J7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capns2Q9D7J7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capns2Q9D7J7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capns2Q9D7J7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capns2Q9D7J7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capns2Q9D7J7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capns2Q9D7J7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capns2Q9D7J7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capns2Q9D7J7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capns2Q9D7J7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capns2Q9D7J7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capns2Q9D7J7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capns2Q9D7J7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Capns2Q9D7J7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Capns2Q9D7J7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capns2Q9D7J7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capns2Q9D7J7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capns2Q9D7J7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capns2Q9D7J7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capns2Q9D7J7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capns2Q9D7J7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capns2Q9D7J7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capns2Q9D7J7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capns2Q9D7J7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capns2Q9D7J7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capns2Q9D7J7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capns2Q9D7J7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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