Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms