Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfsf13Q9D777 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms