Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Borcs6Q9D6W8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Borcs6Q9D6W8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Borcs6Q9D6W8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Borcs6Q9D6W8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Borcs6Q9D6W8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Borcs6Q9D6W8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Borcs6Q9D6W8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Borcs6Q9D6W8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Borcs6Q9D6W8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Borcs6Q9D6W8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Borcs6Q9D6W8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Borcs6Q9D6W8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Borcs6Q9D6W8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Borcs6Q9D6W8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Borcs6Q9D6W8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Borcs6Q9D6W8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Borcs6Q9D6W8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Borcs6Q9D6W8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Borcs6Q9D6W8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Borcs6Q9D6W8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Borcs6Q9D6W8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Borcs6Q9D6W8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Borcs6Q9D6W8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Borcs6Q9D6W8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Borcs6Q9D6W8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Borcs6Q9D6W8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Borcs6Q9D6W8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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