Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rab11fip1Q9D620 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rab11fip1Q9D620 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rab11fip1Q9D620 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rab11fip1Q9D620 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Rab11fip1Q9D620 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rab11fip1Q9D620 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab11fip1Q9D620 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab11fip1Q9D620 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab11fip1Q9D620 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab11fip1Q9D620 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Rab11fip1Q9D620 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab11fip1Q9D620 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Rab11fip1Q9D620 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab11fip1Q9D620 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab11fip1Q9D620 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab11fip1Q9D620 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab11fip1Q9D620 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab11fip1Q9D620 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab11fip1Q9D620 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab11fip1Q9D620 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab11fip1Q9D620 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab11fip1Q9D620 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab11fip1Q9D620 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab11fip1Q9D620 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab11fip1Q9D620 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab11fip1Q9D620 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab11fip1Q9D620 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab11fip1Q9D620 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab11fip1Q9D620 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab11fip1Q9D620 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab11fip1Q9D620 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab11fip1Q9D620 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab11fip1Q9D620 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab11fip1Q9D620 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rab11fip1Q9D620 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rab11fip1Q9D620 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Rab11fip1Q9D620 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rab11fip1Q9D620 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Rab11fip1Q9D620 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rab11fip1Q9D620 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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