Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc81Q9D5W4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc81Q9D5W4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc81Q9D5W4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc81Q9D5W4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc81Q9D5W4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc81Q9D5W4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc81Q9D5W4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc81Q9D5W4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc81Q9D5W4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc81Q9D5W4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc81Q9D5W4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc81Q9D5W4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc81Q9D5W4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc81Q9D5W4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc81Q9D5W4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc81Q9D5W4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc81Q9D5W4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms