Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zcchc13Q9D548 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms