Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc7Q9D541 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms