Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc130Q9D516 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc130Q9D516 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms