Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Y3

Rhox2a, Reproductive homeobox 2A, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox2aQ9D4Y3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rhox2aQ9D4Y3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rhox2aQ9D4Y3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rhox2aQ9D4Y3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rhox2aQ9D4Y3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rhox2aQ9D4Y3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox2aQ9D4Y3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox2aQ9D4Y3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox2aQ9D4Y3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox2aQ9D4Y3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox2aQ9D4Y3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox2aQ9D4Y3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox2aQ9D4Y3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox2aQ9D4Y3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox2aQ9D4Y3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox2aQ9D4Y3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox2aQ9D4Y3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox2aQ9D4Y3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox2aQ9D4Y3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms