Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms