Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J9

4931423N10Rik, MCG52616, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931423N10RikQ9D4J9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4931423N10RikQ9D4J9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4931423N10RikQ9D4J9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4931423N10RikQ9D4J9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
4931423N10RikQ9D4J9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4931423N10RikQ9D4J9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4931423N10RikQ9D4J9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4931423N10RikQ9D4J9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4931423N10RikQ9D4J9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4931423N10RikQ9D4J9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4931423N10RikQ9D4J9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4931423N10RikQ9D4J9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4931423N10RikQ9D4J9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4931423N10RikQ9D4J9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
4931423N10RikQ9D4J9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
4931423N10RikQ9D4J9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4931423N10RikQ9D4J9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4931423N10RikQ9D4J9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4931423N10RikQ9D4J9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
4931423N10RikQ9D4J9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms