Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rufy3Q9D394 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rufy3Q9D394 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms