Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms