Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1T0

Lingo1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo1Q9D1T0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lingo1Q9D1T0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms