Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F5

Mrnip, MRN complex-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MrnipQ9D1F5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MrnipQ9D1F5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MrnipQ9D1F5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MrnipQ9D1F5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MrnipQ9D1F5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MrnipQ9D1F5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MrnipQ9D1F5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MrnipQ9D1F5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MrnipQ9D1F5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MrnipQ9D1F5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MrnipQ9D1F5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MrnipQ9D1F5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MrnipQ9D1F5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MrnipQ9D1F5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms