Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E4

Cysrt1, Cysteine-rich tail protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cysrt1Q9D1E4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Cysrt1Q9D1E4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms