Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
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Hddc3Q9D114 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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Hddc3Q9D114 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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Hddc3Q9D114 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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