Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0T1

Snu13, NHP2-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snu13Q9D0T1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snu13Q9D0T1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms